Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POMPQ9Y244 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms