Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX6Q9UNH7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms