Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB23Q9ULC3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms