Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEFF2Q9UIK5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEFF2Q9UIK5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms