Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS7AQ9UBW8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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