Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFIP11Q9UBB9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFIP11Q9UBB9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms