Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAPAQ9P0L0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAPAQ9P0L0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms