Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVK-5Q9HDB9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms