Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
XKR8Q9H6D3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XKR8Q9H6D3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms