Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms