Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms