Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms