Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A3Q92570 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms