Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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USP53Q70EK8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP53Q70EK8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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