Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms