Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF220Q5VTB9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms