Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms