Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LDLRAP1Q5SW96 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms