Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNT1Q5JUK3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNT1Q5JUK3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms