Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RPL39P5Q59GN2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RPL39P5Q59GN2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RPL39P5Q59GN2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RPL39P5Q59GN2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPL39P5Q59GN2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RPL39P5Q59GN2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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