Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms