Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIK1Q3SY52 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms