Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms