Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HADHQ16836 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHQ16836 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms