Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SNAPC1Q16533 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SNAPC1Q16533 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SNAPC1Q16533 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SNAPC1Q16533 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SNAPC1Q16533 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SNAPC1Q16533 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SNAPC1Q16533 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SNAPC1Q16533 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SNAPC1Q16533 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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