Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD5Q16401 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD5Q16401 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD5Q16401 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD5Q16401 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD5Q16401 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD5Q16401 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD5Q16401 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PSMD5Q16401 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMD5Q16401 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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