Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USF2Q15853 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms