Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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BRD3Q15059 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BRD3Q15059 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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