Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFIXQ14938 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms