Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFR3AQ14156 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms