Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms