Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms