Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RPA4Q13156 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RPA4Q13156 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RPA4Q13156 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPA4Q13156 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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