Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SREBF2Q12772 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms