Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C2orf54Q08AI8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms