Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms