Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms