Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA4AP68366 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms