Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP1P63208 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms