Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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