Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms