Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2BFSP57053 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2BFSP57053 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms