Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH15P55291 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH15P55291 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH15P55291 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH15P55291 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms