Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRXP46100 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRXP46100 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms