Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOLR3P41439 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms