Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORAP35398 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RORAP35398 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms