Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR4A1P22736 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR4A1P22736 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms