Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF3P18847 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF3P18847 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms