Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPB42P16452 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms