Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH1P12830 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH1P12830 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH1P12830 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH1P12830 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH1P12830 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms